נמל מומבסה הפך לשני באפריקה המטפל במיליון TEU בשנה.
ב-2014 רשם הנמל עלייה של 12% בטיפול במכולות, בהשוואה ל-894 אלף TEU ב-2013 ו-903,463 TEU ב-2012.
נכון ל-31 בדצמבר טיפל נמל מומבסה ב-999,997 TEU, כשהמכולה המיליון פורקה מהאונייה "Lilly Schulte" של צ'אינה שיפינג.
הנתון הכניס את נמל מומבסה לרשימת 120 נמלי המכולות הגדולים בעולם.
ב-2014 טיפל הנמל בשיא של 24 מיליון טון מטען כללי, בהשוואה ל-22.3 מיליון טון ב-2013, עלייה של 7.6%.